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蛋白質基因組與人類疾病有了關聯(lián)圖:促進藥物快速識別

據(jù)《科學》雜志近日發(fā)表的一項最新研究,研究人員將人體血液中的數(shù)千種蛋白質數(shù)據(jù)與遺傳數(shù)據(jù)相結合,繪出了蛋白質、基因組與人類疾病的網(wǎng)絡關系圖,顯示了影響這些蛋白質的遺傳差異如何將多種多樣的相關疾病聯(lián)系在一起。

蛋白質故障會導致大多數(shù)器官系統(tǒng)疾病,蛋白質也是當今最常見的藥物靶點。在這項研究中,由劍橋大學醫(yī)學研究委員會流行病學部門和德國查理大學柏林衛(wèi)生研究所科學家領導的國際團隊,利用1萬多人的血液樣本,證明了人類基因組2500個區(qū)域的自然變異與血液中循環(huán)的5000種蛋白質的豐度或功能差異密切相關。

新研究解決了將基礎科學轉化為臨床操作的難題。雖然人類基因組研究已經(jīng)在人體DNA序列中確定了數(shù)千個與疾病相關的變異,但由于將這些變異映射到基因的不確定性,其潛在機制往往仍鮮為人知。通過將這種與疾病相關的DNA變異與編碼蛋白質的豐度或功能聯(lián)系起來,研究團隊為哪些基因參與其中提供了強有力的證據(jù),并確定了蛋白質將遺傳風險轉化為疾病發(fā)作的新機制。

例如,多項全基因組關聯(lián)研究(GWAS)已將人類基因組中稱為KAT8的區(qū)域與阿爾茨海默病聯(lián)系起來,但未能確定該區(qū)域中的哪個基因參與其中。通過結合蛋白質和基因的數(shù)據(jù),團隊在KAT8區(qū)域中識別出一個名為PRSS8的基因,這是阿爾茨海默病的新候選基因。同樣,他們還確定了一種新的子宮內(nèi)膜癌風險基因。

研究團隊利用這些新見解,系統(tǒng)地測試了哪些蛋白質編碼基因會影響疾病。他們發(fā)現(xiàn)了1800多個例子,提供了強有力的證據(jù)表明相應的蛋白質正是起源,并指出了新的潛在治療策略。

研究人員表示,對于大多數(shù)與疾病風險相關的基因組區(qū)域,潛在的因果和機制尚不清楚。該項工作證明了蛋白質在放大疾病致病基因方面的獨特價值,并幫助人們了解遺傳變異導致疾病的機制。通過編碼蛋白質將基因與疾病更直接地聯(lián)系起來,并將促進藥物靶點的快速識別。

總編輯圈點

蛋白質是生物醫(yī)藥領域炙手可熱的研究對象,原因之一就是它們與人類眾多疾病息息相關。最現(xiàn)成的例子是,新冠疫情暴發(fā)之初,中外科學家們先是解析了新冠病毒S蛋白的全長結構,隨后又解析了人體ACE2蛋白全長結構。他們發(fā)現(xiàn),新冠病毒S蛋白正是通過“劫持”人體ACE2蛋白來入侵人體。這為研發(fā)新冠肺炎相關診療方法和藥物提供了思路。值得一提的是,蛋白質作為大分子,同時以其結構復雜而聞名,這為蛋白質相關研究帶來較大難度,其研究進展也往往引發(fā)關注。